Най-големият недостатък на литиевата батерия 18650 е, че нейният размер е фиксиран и не е добре позиционирана, когато е инсталирана в някои преносими компютри или някои продукти. Разбира се, този недостатък може да се каже и като предимство. Това се сравнява с други литиеви батерии, като полимерни литиеви батерии. Това е недостатък по отношение на адаптивния и трансформируем размер. В сравнение с някои продукти с определени спецификации на батерията, това се превърна в предимство.

Производството на 18650 литиеви батерии изисква защитна верига, която да предпазва батерията от презареждане и причиняване на разреждане. Разбира се, това е необходимо за литиевите батерии, което също е често срещан недостатък на литиевите батерии, тъй като материалите, използвани в литиевите батерии, са основно материали от литиево-кобалтов оксид, а материалите от литиево-кобалтов оксид не могат да се разреждат при високи токове, което е безопасно лошо.

Литиевата батерия 18650 изисква високи производствени условия. В сравнение с общото производство на батерии, литиевата батерия 18650 изисква високи производствени условия, което несъмнено увеличава производствените разходи.