18650锂电池最大的缺点就是尺寸已经固定了，安装在一些笔记本或者一些产品上的时候位置不太好。 当然，这个缺点也可以说是优点。 这与聚合物锂电池等其他锂电池相比。 这在可定制和可变形尺寸方面是一个缺点。 相对于一些指定电池规格的产品，它已经成为一个优势。

18650锂电池的生产需要有保护电路，防止电池过充引起放电。 当然，这对于锂电池来说是必须的，这也是锂电池的通病，因为锂电池使用的材料基本都是钴酸锂材料，钴酸锂材料不能大电流放电，安全性较差。

18650锂电池对生产条件要求高。 与一般电池生产相比，18650锂电池对生产条件的要求较高，这无疑增加了生产成本。