18650 লিথিয়াম ব্যাটারির সবচেয়ে বড় অসুবিধা হল এটির আকার স্থির করা হয়েছে এবং কিছু নোটবুক বা কিছু পণ্যে ইনস্টল করার সময় এটি ভাল অবস্থানে থাকে না। অবশ্য এই অসুবিধাটাও একটা সুবিধা বলা চলে। এটি পলিমার লিথিয়াম ব্যাটারির মতো অন্যান্য লিথিয়াম ব্যাটারির সাথে তুলনা করা হয়। এটি কাস্টমাইজযোগ্য এবং রূপান্তরযোগ্য আকারের ক্ষেত্রে একটি অসুবিধা। নির্দিষ্ট ব্যাটারি স্পেসিফিকেশন সহ কিছু পণ্যের তুলনায়, এটি একটি সুবিধা হয়ে উঠেছে।

18650 লিথিয়াম ব্যাটারির উৎপাদনের জন্য একটি সুরক্ষা সার্কিট প্রয়োজন যাতে ব্যাটারি অতিরিক্ত চার্জ হওয়া এবং স্রাব হতে না পারে। অবশ্যই, এটি লিথিয়াম ব্যাটারির জন্য প্রয়োজনীয়, যা লিথিয়াম ব্যাটারির একটি সাধারণ অসুবিধা, কারণ লিথিয়াম ব্যাটারিতে ব্যবহৃত উপাদানগুলি মূলত লিথিয়াম কোবাল্ট অক্সাইড উপাদান, এবং লিথিয়াম কোবাল্ট অক্সাইড উপাদানগুলি উচ্চ স্রোতে স্রাব করতে পারে না, যা নিরাপদ।

18650 লিথিয়াম ব্যাটারির জন্য উচ্চ উত্পাদন শর্ত প্রয়োজন। সাধারণ ব্যাটারি উৎপাদনের সাথে তুলনা করে, 18650 লিথিয়াম ব্যাটারির জন্য উচ্চ উৎপাদন অবস্থার প্রয়োজন, যা নিঃসন্দেহে উৎপাদন খরচ বাড়ায়।