Kerugian terbesar dari baterai lithium 18650 adalah ukurannya telah diperbaiki, dan posisinya tidak baik saat dipasang di beberapa notebook atau beberapa produk. Tentu saja, kekurangan ini juga bisa dikatakan sebagai kelebihan. Ini dibandingkan dengan baterai lithium lain seperti baterai lithium polimer. Ini adalah kerugian dalam hal ukuran yang dapat disesuaikan dan dapat diubah. Dibandingkan dengan beberapa produk dengan spesifikasi baterai tertentu, itu menjadi keunggulan.

Produksi baterai lithium 18650 memerlukan sirkuit perlindungan untuk mencegah baterai diisi daya secara berlebihan dan menyebabkan pelepasan. Tentu saja, ini diperlukan untuk baterai lithium, yang juga merupakan kelemahan umum baterai lithium, karena bahan yang digunakan dalam baterai lithium pada dasarnya adalah bahan lithium cobalt oxide, dan bahan lithium cobalt oxide tidak dapat dilepaskan pada arus tinggi, yang aman.

Baterai lithium 18650 membutuhkan kondisi produksi yang tinggi. Dibandingkan dengan produksi baterai umum, baterai lithium 18650 membutuhkan kondisi produksi yang tinggi, yang tidak diragukan lagi meningkatkan biaya produksi.